Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5Q8R2T8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c5Q8R2T8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms