Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim29Q8R2Q0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim29Q8R2Q0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms