Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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