Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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