Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot6Q8K3P5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms