Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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