Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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