Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Neil3Q8K203 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms