Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpt1Q8K1R3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpt1Q8K1R3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms