Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cnppd1Q8K158 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cnppd1Q8K158 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cnppd1Q8K158 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cnppd1Q8K158 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cnppd1Q8K158 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnppd1Q8K158 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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