Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Card11Q8CIS0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms