Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ep400Q8CHI8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms