Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab43Q8CG50 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab43Q8CG50 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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