Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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