Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28bQ8CEG5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms