Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx30Q8CE50 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx30Q8CE50 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms