Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam228aQ8CDW1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms