Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms