Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrebrfQ8CDG5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms