Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms