Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms