Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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