Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdsp2Q8BX07 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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