Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtpaQ8BWP5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms