Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx17Q8BVL3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms