Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms