Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms