Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup93Q8BJ71 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms