Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms