Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htatsf1Q8BGC0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms