Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms