Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

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Length 893 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rbbp8Q80YR6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rbbp8Q80YR6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp8Q80YR6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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