Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crb2Q80YA8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Crb2Q80YA8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Crb2Q80YA8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Crb2Q80YA8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crb2Q80YA8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms