Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms