Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk40Q7TNL3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms