Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms