Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms