Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh1Q76I79 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms