Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms