Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms