Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms