Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms