Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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