Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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