Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms