Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl3Q6P1Y1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms