Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms