Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd2Q6NXI6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rprd2Q6NXI6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms