Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edrf1Q6GQV7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms