Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cep290Q6A078 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cep290Q6A078 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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